Pour le backup, je pense que de gros disques uniquement USB-2 (un connecteur Firewire et eSATA augmente le prix de manière substantielle), genre WD My Book, sont très bien pour ça. Le gros du boulot est la première sauvegarde, ensuite, elles se font par incréments. Ensuite, ne pas hésiter à trouver un bon logiciel de synchronisation de données, on en a discuté de long en large ici (pour une fois, le Mac semble mieux pourvu que le monde PC, notamment du point de vue convivialité).
Bien sûr, pas question de faire de sauvegarde comme un bourrin, par simple copier/coller ou glisser/déposer dans l'explorateur de fichier. C'est la porte ouverte à la corruption des fichiers. Les logiciels de synchro assurent la vérification de l'intégrité des données, au départ comme à l'arrivée.